GST pull down实验之蛋白表达篇

2023-03-07 09:52 156

背景介绍 /

蛋白表达与纯化在很多实验中都会涉及到,但是很多实验人员都遇到过这种情况:自己辛苦得到的蛋白大都成了包涵体,在菌体裂解上清中几乎无表达。面对后续繁杂的实验,此时心里真是五味杂陈。下面主要就蛋白表达展开介绍,希望大家再做到与此相关的蛋白实验时可以做参考,从此不再“畏惧”包涵体。

蛋白表达

蛋白表达是指用模式生物如细菌、酵母、动物细胞或者植物细胞表达外源基因蛋白的一种分子生物学技术,其中实验室比较常用的是用大肠杆菌进行表达,其优势为表达水平高、成本低、培养条件容易实现等。但是容易形成包涵体且蛋白的折叠性较差,即最终获得的蛋白分为可溶和不溶两种形式存在。接下来我们以大肠杆菌的蛋白表达为例,给大家做下详情介绍。

实验流程
GST-a融合蛋白的制备
1.将质粒转化到大肠杆菌中后,接种到对应抗性的平皿上培养。
2.挑单克隆至3ml对应抗性的LB培养基中,首先进行小规模扩培,继而将LB培养基补加至所需体积继续培养。
3.当菌液OD600到达0.5-0.6时,加入IPTG进行诱导。
4.当菌液OD值到达1左右时,收集菌液进行后续实验。
5.加入裂解液破碎菌体,离心获取上清和沉淀,分别跑胶,验证所研究的目的蛋白表达在上清还是沉淀。
包涵体是什么

包涵体是指常常在蛋白异源表达过程中形成的不溶性和无活性的蛋白质聚集体,特别是在大肠杆菌表达真核细胞蛋白时最为常见。包涵体形成的主要原因有以下几个方面:诱导温度过高、蛋白合成太快、重组蛋白的含硫氨基酸过多等。包涵体蛋白后续的洗涤、溶解、复性与纯化步骤十分复杂,其中包涵体的复性已经成为公认的难题,为此常常让需要制备活性蛋白来开展下游实验的科研工作者们头痛不已。

怎么减少包涵体的产生


包涵体的形成受到多方面因素影响。其一,当蛋白质的表达水平超过总细胞蛋白的2%时,会更容易形成包涵体;其二,如果靶基因的拷贝数较高,且靶基因的表达载体采用的是强启动子,也会造成更多的包涵体产生(因为拷贝数太高时大肠杆菌会产生更强的代谢,而拷贝数低可能会使想要研究的蛋白获取更困难,这意味着需要更长的摇菌及诱导时间。);还有第三个重要因素是诱导剂的浓度,当诱导剂浓度过高,短时间内大量蛋白表达,会有很大一部分蛋白形成包涵体[1]

目前对于减少包涵体的形成常用的方法主要有降低诱导温度、减少诱导剂IPTG的浓度等,但是还没有一种定型的参数,只能通过进行大量预实验逐步确定不同实验的最佳条件。下面是对其他科研工作者们得出的一些实验经验的汇总:

1. 使用中等强度或强度较弱的启动子。
2. 降低诱导温度。较低的生长温度降低了无活性聚集体形成的速率和疏水相互作用,从而可减少包涵体的形成。综合看来,目前较常用到的温度主要有24-30℃,也有很多人尝试16-18℃进行延长时间诱导。
3. 减少诱导剂IPTG的使用量。通过降低蛋白的表达速率,来促使肽链聚集的速率与折叠速率保持平衡,从而减少不溶性包涵体蛋白的表达。例如可以选择浓度为0.10.20.5mMIPTG进行诱导。

融合标签的选择

融合标签能够增加蛋白质的表达水平或溶解性。这些标签由与目标蛋白连接的蛋白质或多肽组成,有助于实现自然折叠,从而使得蛋白不丢失功能活性或使更有活性的蛋白质达到更高水平。下表展示了常用的蛋白融合标签以及其详细信息[2]

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使用多肽蛋白作为融合标签是增加所需蛋白质表达的最可靠的方法。通过了解蛋白质的理化性质,包括pI、净电荷和GRAVY值,有助于选择或设计合适的融合标签。通过利用各种生物信息学工具,可以在mRNA水平上设计融合标签,通过优化TIR来提高下游蛋白质的翻译效率。但是,提高表达效率和增加可溶性表达量是两个不同的问题。对于增加可溶性表达量这个问题,重要的是诱导蛋白质折叠过程的把控,通过降低翻译和折叠的速率可以有效控制。
以上为舍为斯为大家整理的蛋白表达的内容,后续会更新蛋白纯化等相关操作,大家可以持续关注。

[1]Protein recovery from inclusion bodies of Escherichia coli using mild solubilization process. Anupam Singh, Vaibhav Upadhyay, Arun Kumar Upadhyay, Surinder Mohan Singh, and Amulya Kumar Panda.Microb Cell Fact. 2015; 14: 41.

[2]Fusion tags to enhance heterologous protein expression.Mi-Ran Ki, Seung Pil Pack. Applied Microbiology and Biotechnology. 2020;104:2411–2425 .

[3]Solubilization and refolding of bacterial inclusion body proteins.Surinder Mohan Singh, Amulya Kumar Panda.Journal of Bioscience and Bioengineering.2005;99(4):303-310.






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